Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms