Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox10Q04888 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms