Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccl7Q03366 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccl7Q03366 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms