Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Thbs2Q03350 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms