Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pax5Q02650 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pax5Q02650 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms