Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd1Q01822 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms