Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mc1rQ01727 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms