Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms