Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja5Q01231 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms