Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GabpaQ00422 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms