Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms