Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ElocP83940 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ElocP83940 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ElocP83940 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ElocP83940 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ElocP83940 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ElocP83940 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms