Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabpb2P81069 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms