Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb1P70662 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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