Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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