Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtnP63089 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtnP63089 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtnP63089 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtnP63089 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtnP63089 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms