Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfia3P60469 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms