Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nphp4P59240 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms