Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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