Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms