Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hnf4aP49698 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hnf4aP49698 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms