Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cox8bP48772 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms