Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms