Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf9P41274 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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