Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ptger1P35375 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ptger1P35375 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptger1P35375 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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