Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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