Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms