Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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