Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psmb9P28076 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Psmb9P28076 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms