Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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