Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms