Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms