Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms