Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl13aP19253 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms