Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P18530 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P18530 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms