Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gata1P17679 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms