Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms