Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FosbP13346 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FosbP13346 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FosbP13346 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms