Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa7P02830 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms