Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01728 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01728 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01728 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01728 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms