Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01641 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01641 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01641 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01641 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01641 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01641 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01641 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01641 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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