Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms