Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlkO54988 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms