Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timm44O35857 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timm44O35857 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Timm44O35857 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timm44O35857 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms