Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Cited2O35740 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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