Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk2O35491 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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