Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ArxO35085 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ArxO35085 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms