Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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