Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ube3aO08759 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ube3aO08759 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ube3aO08759 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ube3aO08759 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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