Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Casp6O08738 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casp6O08738 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms